Это, конечно, вопрос вкуса. Навскидку:

День в Скансене, просто гулять.
День погулять по городу, экскурсия по воде.
День зайти в военный музей, Ваза/музей Астрид Линдгрен, они рядом (и рядом со Скансеном, кстати), ещё погулять.
День на стандартные музеи и ещё погулять.
Можно помёрзнуть позагорать на неярком северном солнышке, у них там где-то есть пляжи.

Hаверное, 4 дня + Уппсала будет нормально.